こんばんわ、はかせ(夜用)です。はかせと一緒になのをつくりました。
　
はかせ(夜用)は、はかせの影むしゃむしゃなロボットなのです。
夜中ははかせ(夜用)が、はかせの代わりにお菓子を食べたり遊んだりしてるのです。
なのも阪本も寝てるので、好き勝手できるのです。ひふふ。
でもバレたら怒られるから、はかせ(夜用)の存在はナイショなのです。誰も知らない知られちゃいけないのです。
　
はかせとはかせ(夜用)は、朝と夕方に記憶をれぷりけーしょんしているので、いつも一心同体なのです。
一日がにじゅーよじかん使えるので、とってもおトクなのです。
　
なのが知らないうちに改造しているのも、このはかせ(夜用)のシワザなのです。
なのの頭にこの絶縁紙をはさめば、なのは何をしても起きないからバレないのです。
今日はこっそりコケ機能をつけるのです。セコーロケットは静止軌道まで行けるスグレモノなのです。
でも、なのは太ってないからスペースデブリにはならないんだけど。(←意味不明)
　
　
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「はかせはなのをいつの間に改造しているのか」
東雲研究所の隠された360の謎、そのひとつに対する、一つの可能性でございます。
　
実はSAIで厚塗りしてみようと思ったんだけど、うまく濃淡がコントロールできずに断念。ﾄﾎｰ。

Taking from the knowledge of the previous one. Since Nano might be designed from Hakase's mother. Then it would be fitting if there's a Nano Mk2 designed from Hakase herself. However what prank she might be pulling is beyond me.

"Reaction function" is literally koke kinou.
The subbed version translated that term as "Reaction function" in episode 15, but I'm not sure what the actual meaning of koke is in this context.

Good evening, I'm the Professor (Nighttime version). I built Nano with the Professor.
　
I'm a clone-bot of the Professor.
At night, I play around and eat snacks for the Professor.
Nano and Sakamoto are sleeping, so I can do whatever I want with them. Hee-hee-hee.
But if they found out, they'd get real mad, so I gotta keep myself a secret. Nobody knows about me, and nobody can find out. 　

The Professor and me synchronize our memories each morning and night, so it's like we're the same person.
It's great being able to take advantage of all 24 hours in the day.

I'm the one responsible for modifying Nano without her knowing about it.
I just stick this insulating paper in her head, and she won't wake up for anything, so she never finds out.
Today I secretly gave her a reaction function.
The Cheapskate! rockets are so amazing they could take her into orbit.
But Nano isn't very fat, so she won't turn into space debris (←cryptic)

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"When does the Professor do all these modifications to Nano?"
This is one possible answer to one of the 360 mysteries of Shinonome Laboratories.
I actually wanted to try coloring this in SAI, but it doesn't give you much control over the shading, so I gave up.